Ідея створення інституту у м. Херсоні виникла у середині 90-х років минулого століття. На той час, помісні церкви потребували підготовлених служителів. Так, восени 1996 року розпочала роботу ініціативна група зі створення інституту, а менш ніж за рік, у серпні 1997 року, ТХІ було офіційно зареєстровано державою. Засновником інституту виступило Об’єднання церков євангельських християн-баптистів Херсонської області. У період з 1999 по 2022 роки ТХІ мав статус повного члена Євро-Азіатської Акредитаційної Асоціації (ЄААА). До 2019 року всі навчальні програми та стандарти викладання в інституті відповідали міжнародним стандартам ЄААА на академічному та духовному рівнях. Бібліотека, аудиторії, гуртожиток та інші будівлі ТХІ також відповідали вимогам асоціації, які є єдиними для всіх навчальних закладів асоціації. У травні 2019 року ТХІ отримав державну ліцензію. Відтак, вперше в історії євангельських християн України, вищий духовний навчальний заклад отримав державну ліцензію для підготовки служителів за спеціальністю 041 «Богослов’я». У травні 2024 року навчальний заклад отримав акредитаційний сертифікат про присудження кваліфікації «Бакалавр богослов’я» від Європейської ради богословської освіти (ЕСТЕ), яку розпорядженням Кабінету Міністрів України від 28 червня 2024 року за № 603-р внесено до Переліку іноземних акредитаційних агентств та агентств із забезпечення якості вищої освіти, які видають сертифікати про акредитацію освітніх програм, що визнаються в Україні. Отримання акредитації від ЕСТЕ стало підтвердженням надання якісної академічної освіти в інституті, що відповідає вимогам Європейського простору вищої освіти. У травні 2025 року інститут отримав від Міністерства освіти і науки України державну ліцензію на другому (магістерському) рівні вищої освіти для підготовки фахівців за спеціальністю В8 «Богослов’я». Таким чином, ТХІ став першим закладом вищої духовної освіти євангельського спрямування, що отримав право здійснювати підготовку магістрів за державними стандартами. Сьогодні ТХІ навчає студентів п’яти різних деномінацій, і це доказ реальності міжденомінаційної співпраці християн України. Студенти інституту різняться за віком, темпераментом, вихованням та інтересами, але всі вони об’єднані спільною метою – служити Христу і виконувати Його доручення. Приєднуйся до нашої християнської сім’ї!